تتألف عضوية مجلس الرؤساء التنفيذيين من الـ 29 مؤسسة المكونة لمنظومة الأمم المتحدة، وهي: منظمة الأمم المتحدة التي يمثلها الأمين العام للأمم المتحدة بوصفه رئيس مجلس الرؤساء التنفيذيين؛ و 15 وكالة متخصصة (الوكالات المتخصصة هي منظمات مستقلة تعمل بتنسيق مع الأمم المتحدة ومع بعضها من خلال آلية تنسيق المجلس الاقتصادي والاجتماعي على المستوى الحكومي الدولي، ومن خلال مجلس الرؤساء التنفيذيين على المستوى المشترك بين الأمانات)؛ و 11 صندوقا وبرنامجا تابعة لمنظومة الأمم المتحدة؛ ومنظمتان متصلتان بها.

الأمم المتحدة

منظمة العمل الدولية

منظمة الأمم المتحدة للأغذية والزراعة 

منظمة الأمم المتحدة للتربية والعلم والثقافة

منظمة الطيران المدني الدولي

منظمة الصحة العالمية

مجموعة البنك الدولي

صندوق النقد الدولي

الاتحاد البريدي العالمي

الاتحاد الدولي للاتصالات

المنظمة العالمية للأرصاد الجوية

المنظمة البحرية الدولية

المنظمة العالمية للملكية الفكرية

الصندوق الدولي للتنمية الزراعية

منظمة الأمم المتحدة للتنمية الصناعية

الوكالة الدولية للطاقة الذرية

منظمة التجارة العالمية

منظمة السياحة العالمية

مؤتمر الأمم المتحدة للتجارة والتنمية

برنامج الأمم المتحدة الإنمائي

منظمة الأمم المتحدة للبيئة

مفوضية الأمم المتحدة لشؤون اللاجئينن

وكالة الغوث الدولية لإغاثة اللاجئين الفلسطينيين في الشرق الأدني وتشغيلهم

منظمة الأمم المتحدة للطفولة

صندوق الأمم المتحدة للسكان

برنامج الأغذية العالمي للأمم المتحدة

برنامج الأمم المتحدة للمراقبة الدولية للمخدرات

برنامج الأمم المتحدة للمستوطنات البشرية

هيئة الأمم المتحدة للمرأة